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ca88甘薯SNP标记开发研究成果在《JIA》上发表

来源:亚洲城唯一官网 时间:2016-09-22 作者:亚洲城

        单核苷酸多态性(SNP)是近年来被认为最有发展潜力的第三代分子标记ㄍ。ca88甘薯育种团队利用Illumina RNA-seq技术,从淀粉含量、薯干产量和茎线虫病抗性差异明显的徐781和徐薯18测序结果中获得1,386个SNP候选位点,进一步采用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)的特异性扩增方法,利用候选SNP位点设计153组Tetra-primer ARMS-PCR引物,对徐781和徐薯18候选 SNP位点进行检测,103组引物的PCR产物有差异,差异检出率为67.97%ㄍ。另外,有32组引物扩增PCR产物的电泳条带与预期片段大小吻合,这32组引物所对应的候选SNP位点在徐781和徐薯18两样本之间得到很好的验证ㄍ。通过对温度梯度Tetra-primer ARMS-PCR的每个退火温度下所对应的PCR产物的电泳结果的观察,确定最后所得32组Tetra-primer ARMS-PCR引物反应体系的最适退火温度(Ta)ㄍ。结果表明,Tetra-primer ARMS-PCR方法适合甘薯SNP分子标记的检测,可用于甘薯SNP分子标记的开发及甘薯分子连锁图谱的构建ㄍ。

        该研究成果在线发表在《Journal of Integrative Agriculture》(IF 0.724)上,后猛副研究员和ca88招收硕士毕业生许家磊为该研究论文的共同第一作者,李强研究员为通讯作者ㄍ。该研究得到了江苏省农业科技自主创新资金项目(CX (13) 2032)、现代农业产业技术体系建设专项(CARS-11)和国家高技术研究发展计划(2012AA101204)的资助ㄍ。
论文链接:
http://www.chinaagrisci.com/Jwk_zgnykxen/EN/abstract/abstract10579.shtml#abstract_tab_content
 
甘薯育种室供稿

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